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1.
Braz. j. biol ; 69(2): 447-453, May 2009. ilus, graf, tab, mapas
Article in English | LILACS | ID: lil-519160

ABSTRACT

The aim of this work was to analyze genetic variability in 18 populations of Maytenus ilicifolia, and representatives of Maytenus aquifolia and Maytenus evonymoidis, collected in the states of Mato Grosso do Sul, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul, using RAPD molecular markers. Considering total samples of the three species, 263 amplified fragments were identified, of which 72.2% showed to be polymorphous. The index of similarity (Jaccard coefficient) was on average 0.64 between M. ilicifolia and M. aquifolia; 0.47 between M. ilicifolia and M. evonymoidis; and 0.44 between M. aquifolia and M. evonymoidis. The analysis of groupings by the UPGMA algorithm allowed to clearly separate the three analyzed species. In determining the variability in M. ilicifolia, 222 bands were identified, on average 11.1 bands per primer, being 43.2% polymorphous. The index of similarity (Jaccard coefficient) in the bulks of each population in M. ilicifolia was, on average, 0.92 and the index of similarities among the populations was 0.83. The analysis of groupings with the UPGMA algorithm and the analysis of the main coordination (PCO), allowed the separation of the analyzed populations into three groups, the populations from the south of Rio Grande do Sul and the population from Mato Grosso do Sul standing out. A relation between the groupings found and the edaphoclimatic conditions of the collecting places was observed.


O objetivo deste trabalho foi analisar a variabilidade genética em dezoito populações de Maytenus ilicifolia, e representantes de Maytenus aquifolia e Maytenus evonymoidis, coletadas nos Estados do Mato Grosso do Sul, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul, utilizando marcadores moleculares RAPD. Considerados todos os representantes das três espécies, foram identificados 263 fragmentos amplificados, dos quais 72,2% mostraram-se polimórficos. O índice de similaridade (coeficiente de Jaccard) foi em média de 0,64 entre M. ilicifolia e M. aquifolia, de 0,47 entre M. ilicifolia e M. evonymoidis e de 0,44 entre M. aquifolia e M. evonymoidis. A análise de agrupamentos através do algoritmo UPGMA permitiu separar claramente as três espécies analisadas. Na determinação da variabilidade dentro de M. ilicifolia foram identificadas 222 bandas, em média de 11,1 bandas por primer, sendo 43,2% polimórficas. O índice de similaridade (coeficiente de Jaccard) dentro dos bulks de cada população em M. ilicifolia foi em média de 0,92, e índices de similaridade entre as populações de 0,83. A análise de agrupamentos através do algoritmo UPGMA e análise de coordenadas principais (PCO), permitiram separar as populações analisadas em três grupos, destacando as populações do sul do RS e a de MS das outras avaliadas. Foi observada uma relação entre os agrupamentos encontrados e as características edafoclimáticas dos locais de coleta.


Subject(s)
Genetic Variation/genetics , Maytenus/genetics , Algorithms , Brazil , Genetic Markers/genetics , Maytenus/classification , Random Amplified Polymorphic DNA Technique , Species Specificity
2.
Braz. j. biol ; 67(4,supl): 957-961, Dec. 2007. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-474238

ABSTRACT

Maytenus ilicifolia is a medicinal plant largely used in the South Brazilian folk medicine. The aim of this study was to quantify the intra and inter populational genetic variability in three populations of M. ilicifolia, focusing on the genetic conservation of this species, which has been threatened by anthropic action. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers were used to analyze 30 plants of each of the three populations collected in the Alto Uruguai Gaúcho region. Fourteen selected primers generated a total of 158 bands, 71.5 percent of which were polymorphic. The comparison of Jaccard’s distances showed that the intra populational variation was higher than the inter populational variability, and cluster analysis allowed the separation of the three populations. Just 7.6 percent of the bands were specific of at least two populations. Data indicate that the analyzed M. ilicifolia populations represent a single genetic pool, and therefore any of the population thoroughly can represent the overall genetic variability of the species in the sampled region.


Maytenus ilicifolia é uma planta medicinal bastante utilizada na medicina popular da região sul do Brasil. O objetivo deste estudo foi quantificar a variabilidade genética intra e interpopulacional em três populações de M. ilicifolia visando a conservação genética desta espécie, que se encontra ameaçada pela ação antrópica. Marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foram utilizados para analisar 30 plantas de cada uma das três populações coletadas na região do Alto Uruguai Gaúcho. Foram selecionados 14 primers, que geraram 158 bandas, das quais 71,5 por cento foram polimórficas. A comparação das distâncias de Jaccard mostraram que a variabilidade intra populacional foi maior que a interpopulacional, e a análise de agrupamentos permitiu a separação das três populações. Somente 7.6 por cento das bandas foram específicas de pelo menos duas populações. Os resultados indicam que as populações de M. ilicifolia analisadas representam um único conjunto gênico, de tal forma que qualquer uma das populações pode representar a variabilidade genética geral da espécie na região.


Subject(s)
Genetic Variation , Maytenus/genetics , Cluster Analysis , Genetic Markers/genetics , Random Amplified Polymorphic DNA Technique/methods
3.
Braz. j. biol ; 67(4)Nov. 2007.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467920

ABSTRACT

Maytenus ilicifolia is a medicinal plant largely used in the South Brazilian folk medicine. The aim of this study was to quantify the intra and inter populational genetic variability in three populations of M. ilicifolia, focusing on the genetic conservation of this species, which has been threatened by anthropic action. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers were used to analyze 30 plants of each of the three populations collected in the Alto Uruguai Gaúcho region. Fourteen selected primers generated a total of 158 bands, 71.5% of which were polymorphic. The comparison of Jaccard’s distances showed that the intra populational variation was higher than the inter populational variability, and cluster analysis allowed the separation of the three populations. Just 7.6% of the bands were specific of at least two populations. Data indicate that the analyzed M. ilicifolia populations represent a single genetic pool, and therefore any of the population thoroughly can represent the overall genetic variability of the species in the sampled region.


Maytenus ilicifolia é uma planta medicinal bastante utilizada na medicina popular da região sul do Brasil. O objetivo deste estudo foi quantificar a variabilidade genética intra e interpopulacional em três populações de M. ilicifolia visando a conservação genética desta espécie, que se encontra ameaçada pela ação antrópica. Marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foram utilizados para analisar 30 plantas de cada uma das três populações coletadas na região do Alto Uruguai Gaúcho. Foram selecionados 14 primers, que geraram 158 bandas, das quais 71,5% foram polimórficas. A comparação das distâncias de Jaccard mostraram que a variabilidade intra populacional foi maior que a interpopulacional, e a análise de agrupamentos permitiu a separação das três populações. Somente 7.6% das bandas foram específicas de pelo menos duas populações. Os resultados indicam que as populações de M. ilicifolia analisadas representam um único conjunto gênico, de tal forma que qualquer uma das populações pode representar a variabilidade genética geral da espécie na região.

4.
Acta amaz ; 33(4): 651-662, Dec. 2003. graf, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-574683

ABSTRACT

Foram examinados brânquias, fossas nasais e intestinos de tambaquis (Colossoma macropomum) capturados em duas localidades na Amazônia, próximas aos municípios de Tefé/Coari, no médio rio Solimões, Estado do Amazonas e de Santarém no baixo rio Amazonas, Estado do Pará. Nove espécies de parasitas foram encontradas: três da classe Monogenoidea; Anacanthorus spathulatus, Linguadactyloides brinkmanni e Notozothecium sp.; uma de Trematoda da família Paramphistomidae; uma do filo Acanthocephala, Neoechinorhynchus buttnerae, duas do filo Nematoda, Spirocamallanus sp. e Procamallanus sp. e duas da subclasse Copepoda, Gamidactylus jaraquensis e Perulernaea gamitanae. Foram registradas pela primeira vez parasitando o tambaqui, o monogenético Notozothecium sp., espécimens imaturos da família Paramphistomidae, larvas do nematóide Procamallanus sp. e o copépodo Gamidactylus jaraquensis. Os paranfistomídeos e Procamallanus sp. foram encontrados apenas nos hospedeiros da região de Tefé/Coari. Foi observada pouca variabilidade na composição da parasitofauna do tambaqui, entre os dois locais estudados. As espécies Anacanthorus spathulatus, Notozothecium sp., Neoechinorhynchus buttnerae e Perulernaea gamitanae, apresentaram bom potencial como indicadores biológicos para o tambaqui.


Specimens of Colossoma macropomum, an Amazonian characoid, captured at two different sites, one near the towns of Tefé and Coari in the middle Solimões River, state of Amazonas, and the other near the town of Santarém, lower Amazon River, state of Pará, were examined for parasites. Nine parasite species were found. Three belong to the class Monogenoidea: Anacanthorus spathulatus, Linguadactyloides brinkmanni and Notozothecium sp. Immature specimens belonging to class Trematoda, family Paramphistomidae were found. One belongs to the phylum Acanthocephala, Neoechinorhynchus buttnerae. Two belong to the phylum Nematoda, Spirocamallanus sp. and Procamallanus sp. Two belong to the subclass Copepoda, Gamidactylus jaraquensis and Perulernaea gamitanae. The monogenetic Notozothecium sp., the immature specimens of paramphistomids, the larvae of Procamallanus sp. and the copepod Gamidactylus jaraquensis were found on C. macropomum for the first time. The paramphistomids and Procamallanus sp. were found only in hosts from the Tefé/Coari area. There was little variability between the two sites in the parasite fauna of C. macropomum. The results of this study indicate that Anacanthorus spathulatus, Notozothecium sp., Neoechinorhynchus buttnerae and Perulernaea gamitanae may be as potential biological indicators for C. macropomum populations.


Subject(s)
Parasites , Biomarkers , Copepoda , Acanthocephala , Fishes , Population Health , Nematoda
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